Os laboratórios da FABA destinados aos cursos da área da saúde são altamente elogiados por suas instalações e equipamentos de alta qualidade, que seguem rigorosamente os padrões dos órgãos fiscalizadores. Eles possuem mobiliário, iluminação e ventilação naturais e artificiais adequados, isolamento acústico, equipamentos de prevenção contra incêndios, boa higiene e equipamentos de segurança. Os laboratórios especializados abrangem as áreas básicas de Anatomia, Fisiologia, Histologia, Patologia Geral, Microbiologia, Imunologia, Parasitologia, Citologia, Embriologia, Química, Bioquímica, Farmacologia, Biofísica, Genética e Evolução. Há também o laboratório de Semiologia e Semiotécnica de Enfermagem, que atende a população do entorno da FABA em Campo Grande.
As salas de aula da FABA cumprem os padrões exigidos de tamanho, limpeza, luminosidade, acústica e ventilação, além de manter o mobiliário e equipamentos em bom estado de conservação para proporcionar conforto durante as atividades planejadas. Elas também oferecem acessibilidade adequada para pessoas com necessidades especiais.